Белгородский госуниверситет занял 17 позицию в Национальном рейтинге университетов 2016 года по параметру «Исследования», набрав в общей сумме 643 балла из 1000.
Общая оценка исследовательской деятельности вузов складывалась из нескольких критериев, среди которых реализуемые университетами программы подготовки исследователей (магистратура, аспирантура, докторантура) и вклад университета в формирование научно-образовательной элиты страны; уровень научной продуктивности научно-педагогических работников университета по данным систем Scopus и РИНЦ; уровень развития в университетах высокопроизводительных вычислений и математического моделирования.
Абсолютным лидером рейтинга, набравшим максимальное количество баллов, стал МГУ имени М.В.Ломоносова. В тройке лидеров помимо него и другие московские вузы – национальный исследовательский ядерный университет «МИФИ» и национальный исследовательский физико-технический институт.