Божественную литургию в память о святом совершил митрополит Белгородский и Старооскольский Иоанн. В 1919 году владыку Никодима арестовали за проповеди прямо в алтаре Троицкого собора, а затем расстреляли и похоронили в общей могиле.
Спустя полгода мощи погребли в Свято-Троицком мужском монастыре.
В ноябре 2012 года останки епископа были обнаружены в кирпичном склепе во время поисковых работ у фундамента строящегося нового здания Белгородской митрополии.
Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл признал останки мощами Белгородского епископа и назначил 2 ноября днём памяти священномученика. Его гробницу включили в список объектов культурного наследия.